התקופה השנייה בתור השלישון שהחלה לפני 25 מיליוני שנים ונמשכה עד לפני 2 מיליוני שנים.
התקופה מחולקת ל-2 תקופות משנה: מיוקן ופליוקן.
מתקופת הניאוגן מצויים בכמה אזורים בארץ סלעי חוור, חלוקים, חול וחרסית. בשכבות אלה מצויים בבקעת הירדן ובמורדות הכינרת סלעי בזלת, המעידים על פעילות וולקנית.