שימוש בחיידקים בעלי יכולת לפרק תרכובות וחומרים לשם טיהור שטחי קרקע או מאגרי מים מפסולת.
חיידקים מנוצלים:
- לטיהור שפכים עירוניים;
- לניקוי ים מנפט שנשפך במקרים של תאונות אקולוגיות (ראה/י: אקסון-ולדז).
- לצמצום כמות המזהמים האורגניים הנפלטים ממפעלים תעשייתיים;
- לפירוק שמנים וחומרים מדיפי ריח-רע ממפעלי מזון. כיום מפתחים במעבדות מינים של חיידקים שיוכלו לפרק תרכובות וחומרים אי-אורגניים כמו הפלסטיק.